Cuando por fin regresó con el profesor Oak, el profe le dijo a Ash que se aventurara hacia Johto para entregarle la bola GS ball a Kurt, un famoso experto en pokebolas, así que lo hizo mientras Tracey se quedó con Oak como su asistente. Brock reaparece y se une de nuevo al grupo.

Al llegar a dicho continente, se enteró de los gimnasios de la liga Johto, se inscribió, y comenzó a enfrentarse a los líderes de gimnasio de los videojuegos Pokemon Oro, Plata, y Cristal. Aquí Ash ya utilizaría diferentes poke-compańeros, como Chikorita (en vez de Bulbasaur - hoja) que evoluciona más tarde en Bayleef, Cyndaquil (en vez de Charizard - fuego), y Totodile (en vez de Squirtle - agua). Pronto tiene que dejar a algunos de sus pokémon como Charizard, del cual se despide en un emotivo capítulo dejándolo en el Valle Charirífico para que entrene. Otro que también se va es Squirtle, luego de participar en un torneo de bomberos pokémon, ya que decide regresar con su antiguo escuadrón, y Bulbasaur que lo deja con Oak en Pueblo Paleta. Así mismo a medida que se van unos pokémon otros llegan como Noctowl (bastante especial) o Phanpy.

Después de vencer los ocho gimnasios Johto finalmente compite en la Conferencia Plateada, a la que accede con los pokémon atrapados en su viaje y algunos otros que ya tenía antes. En este torneo Ash al fin vence a Gary Oak pero queda eliminado por Harrison, un entrenador de la región de Hoenn.

Lista de capítulos

Los nombres de los capítulos son los nombres utilizados en Latinoamérica.