El juego mantiene lo básico de sus predecesores de Pokémon Rojo y Azul, su mecánica, su estilo de exploración, las batallas y gráficos, así como parte del escenario de Kanto, pero agrega muchas novedades:

1. Un nuevo mundo, Johto con un mapeado y recorridos distintos, además de la antigua región, Kanto.
2. Nueva historia y personajes, empezando por los protagonista (aunque en esencia se vuelve a repetir el esquema de ser el mejor entrenador pokemon del mundo).
3. 100 Pokemon nuevos, junto a los 151 de la primera parte.
4. Posee un reloj interno, que hace que haya acontecimientos en determinadas horas, hay un sistema de día y noche; algunos pokemon aparecen en determinadas horas, algunos movimientos afectan dependiendo de la hora del día, etc.
5. El POKÉGEAR, un aparato que guarda los números de teléfonos de algunos personajes, esta la hora del reloj; con el avanzar de la aventura también se tiene acceso al mapa y la radio.
6. Dos nuevos tipos: steel y dark (acero y oscuro/siniestro)
7. El género en los pokemon (macho y hembra), con esto se agregó la guardería y así obtener crías de nuestras criaturas, la posibilidad de tener movimientos exclusivos criando (llamados movimientos huevos) y así como pokemon bebes, que solo aparecen apareando determinada especies (como Pichu que se obtiene criando a un Pikachu o Raichu hembra con un macho compatible). (Crianza pokemon)
8. La división de la estadística, Especial, en: Ataque especial y Defensa Especial.
9. Muchos objetos nuevos y la posibilidad de guardarlos mejor en la mochila, además de mayor capacidad. Los objetos pueden ser equipados por los pokemon, algunos sirven en las batallas. Las bayas son objetos obtenibles en árboles.
10. Nuevas "Pokebolas" y un nuevo material para fabricar algunas de ellas, los "Bonguris" (Apricorns), recogidos en los árboles.
11. Nuevos movimientos para los Pokemon, además de cambios de algunos de sus predecesores.
12. Equilibrio en los combates (ahora el tipo psíquico no es tan poderoso).
13. Pokemon con otros colores, llamados comúnmente como "shinny" o brillantes, son pokemon que tienen una probabilidad muy baja de salir, se caracteriza por tener un color distinto a habitual, no es detectable en la Gameboy original.
14. Nuevas evoluciones de Pokemon: Por felicidad, intercambiado con un objeto equipado, por piedra solar (similar a la piedra lunar de su predecesor).
15. Sustitución de la zona safari por el concurso de "Caza de bichos" en el Parque Nacional.
16. Nuevo sistema de genes, así se saca entre otros el calculo del nuevo movimiento poder oculto, que es de gran importancia en las batallas pokemon, ya que puede ser de cualquier tipo.
17. Está el nuevo cambio de estado de "enamoramiento" (amistad).
18. En la versión japonesa, se puede obtener a Celebi en el propio juego.

Este juego contiene una gran cantidad de mejoras no incluidas en Gold & Silver. en esta imagen podemos observar la forma del juego, es muy colorida, este juego contiene algunos nuevos sitios como por ejemplo la nueva Torre de Las batallas ubicada cerca de cuidad olivo, esta torre es un centro para los entrenadores demostrar sus habilidades pero es extremadamente dificil vencerlos ya que ellos tienen el mismo nivel que tus pokemon y los equipan para mejorar sus ataques y defensas.

Tanto Pokémon Oro y Plata son muy similares a Pokémon Cristal pero aquí esta una lista de algunas características de éste juego:

• El Pokemon Suicune aparece en la portada del juego, es mucho más fácil de atrapar en "Oro y Plata" y posee algunos movimientos diferentes, como Rayo Aurora. Nueva intro en el juego con Suicune.
• Animaciones para los pokemon rivales en los combates
• En Ciudad Trigal hay un huevo que al eclosionar puede salir cualquiera de los siguientes pokémons: Cleffa, Elekid, Igglybuff, Magby, Pichu, Smoochum, Togepi, Tyrogue; al azar, con el ataque Puńo suerte, además de mayor posibilidad que salgan "shinny".
• Se puede elegir como personaje controlable a un nińo o una nińa.
• El color y la forma de la mochila, del pokegear son de forma diferente.
• Posee más colores simultáneos y pantalla y mejor calidad gráfica, que lo hace incompatible con la Game Boy clásica.
• Aparece un recuadro en la parte inferior de la pantalla con el nombre de la localización a la hora de llegar a un pueblo u otro lugar.
• Corrección de varios bug (dificultad para clonar, por ejemplo).
• Nuevos lugares como la Torre Batalla para competir con 7 entrenadores Pokemon, si se gana a todos, se obtiene un premio.
• Modificación de antiguos lugares como las Ruinas Alfa o la Guarida Dragón.
• Más objetos claves como la Campana Clara o la Tarjeta azul.
• Un "tutor" que enseńa, los ataques Lanzallamas, Rayo Hielo y Rayo. Cambiando la estrategias de los combates.
• Algunos pokemon aprenden algunos movimientos nuevos y pierden otros. Eevee sabe Relevo, deja de aprender Foco energía; Cloyster sabe Púas, etc.
• Mejor control de nuestro personaje.